น้ำตกคลองนารายณ์เป็นแหล่งน้ำศักดิ์สิทธิ์ 1 ใน 18 แห่งทั่วประเทศ ซึ่งนำน้ำมาใช้ในพระราชพิธีบรมราชาภิเษก คือพระราชพิธีในการสถาปนาซึ่งเป็นพระมหากษัตริย์
น้ำตกคลองนารายณ์ อยู่ห่างจากตัวเมือง 6 กม. แยกจากถนนสายจันทบุรี-ตราด ระหว่างหลักกิโลเมตร ที่ 338-339 ประมาณ 2 กม. จากนั้นเดินเท้าอีก 2 กม. เหมาะสำหรับคนที่ชอบเดินป่า มีความสูง 25 เมตร พระบาทสมเด็จพระจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว เคยเสด็จประพาสเมื่อ พ.ศ. 2419
คลองนารายณ์นั้น มีเรื่องเล่ากันมาว่าที่ได้ชื่อว่า คลองนารายณ์ ก็ เพราะต้นธารน้ำไหลออกมาจากถ้ำซึ่งภายในถ้ำนั้น มีเทวรูปพระนารายณ์สถิตอยู่ ชื่อนี้เป็นที่รู้จักกันมานานแล้ว ความจริงต้นของธารน้ำสายน้ำจริงๆ คือ น้ำตกสระบาปที่สูงมาก และไหลพุ่งออกมาจากผาสูงประมาณ 20 เมตรเศษ ลงอ่าง จากนั้นจึงไหลผ่านลงมาตามลาดเขาและมีอ่างขังน้ำที่อยู่ชั้นล่าง ที่สำคัญแห่งหนึ่ง เรียกว่า “ อ่างหงส์ ” ซึ่งพระบาทสมเดชพระจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว รัชกาลที่ 4 เมื่อครั้งยังทรงผนวชเคยเสด็จประพาส เมื่อ พ.ศ.2400 (จ.ศ.1219)และลงสรงน้ำในอ่างนี้ กับโปรดให้สร้างเจดีย์และศาลาประทับร้อนไว้ด้วย พระราชทานชื่อเจดีย์ว่า “ จุลสีห์จุมภตเจดีย์ ” เมื่อครั้งพระบาทสมเดชพระจุลจอมเกล้าเจ้าอยู่หัว รัชกาลที่ 5 เสด็จประพาสจันทบุรี เมื่อ พ.ศ. 2419 ก็ได้เสด็จไปที่น้ำตกสระบาป และลงสรงน้ำในอ่างหงส์ น้ำในลำธารนี้ใช้เป็นน้ำศักดิ์สิทธิ์มาตั้งแต่สมัยใดไม่ทราบชัด
ปัจจุบันนี้น้ำตกคลองนารายณ์ ซึ่งได้รับการคัดเลือกให้เป็น “ หนึ่งตำบลหนึ่งผลิตภัณฑ์ ” ของตำบลคลองนารายณ์ อำเภอเมืองจันทบุรี เพื่อเป็นการส่งเสริมการท่องเที่ยว และสร้างรายได้ให้กับชุมชนและท้องถิ่น จึงได้ดำเนินการก่อสร้างอาคารศูนย์บริการขนาดย่อย และก่อสร้างอาคารบริการนักท่องเที่ยวและศาลาชมวิว แบบ 8 เหลี่ยม เพื่ออำนวยความสะดวกแก่นักท่องเที่ยว และเป็นการสร้างรายได้ให้แก่ชุมชนและท้องถิ่น